辣椒中有可以刺激人的部分器官的辣椒素，使人的机体产生各种不同的反应。许多人因知道辣椒可以促进食欲便以此为借口多吃而不加节制，而造成便秘、上火、长痘等各种体现体内失调的症状。辣椒虽然可以加速身体许多器官组织的运转，加快新陈代谢，但是它的“副作用”也有许多，对于某些人来说，吃辣椒更是个禁忌。
心脏不好
辣椒中的辣椒素会使循环血量增加，心跳加快，诱发心动过速。因此心脑血管疾病患者应少吃辣椒，否则会妨碍病情的好转。
肾不好
辣椒素是通过肾脏排泄的，对肾脏有一定的刺激作用，如果肾不好的人经常吃辣，会加重肾脏负担。
胃酸过多
辣椒素会引起胃酸分泌增加，胃酸多了可引起胆囊收缩，导致胆道口括约肌痉挛，造成胆汁排出困难，从而诱发胆囊炎、胆绞痛及胰腺炎
便秘
辣椒素具有刺激性，会加重便秘症状。痔疮患者进食后还可能引起痔静脉充血和水肿，导致疾病恶化，诱发肛门脓肿。
口腔溃疡
辣椒刺激性较大，不但会诱发疼痛，还会刺激溃疡面，使其进一步扩大，久病不愈
眼病病人
有角膜炎、红眼病等问题的人如果吃了辣椒，很可能会造成眼皮肿胀、眼睛发烫甚至眼压升高等不适症状。
甲亢
甲亢患者本身心率就很快，食用辣椒后，心跳速度会更快，症状更为明显。
肠胃不好
患慢性胃炎、胃溃疡、食管炎的人如果经常吃辣，辣椒素会刺激黏膜充血水肿，加速肠胃蠕动，从而引起腹泻、腹痛等症状，对消化功能也会有影响。
虽然有许多人不宜吃辣椒，但偶尔尝一点还是有好处的，特别是在食欲不太好的情况下。不过，空腹吃辣椒可就真的不是个好习惯，很容易使某些病情恶化。
靠吃辣的减肥，这事看起来有些不靠谱，可是另一个传说辣椒容易导致胃癌，这事靠谱吗？
其实啊，吃辣椒会致癌，这事更不靠谱！某种意义上讲，吃辣椒有助防治胃癌。
有细胞实验表明胃癌细胞比正常细胞更容易被辣椒素诱导凋亡，且辣椒素还能引起人结肠癌细胞的凋亡。另外我们总是被叮嘱少吃辛辣的东西，特别是胃肠功能不好的时候更要忌辣，但有研究显示辣椒素能够保护胃粘膜，并可通过抑制胃酸分泌、增加胃粘膜血流量治疗胃溃疡。
虽然，吃辣椒可以预防胃癌，但是过度吃辣，只会破坏神经末梢的感觉，久而久之，会使胃肠黏膜损伤，从而引起慢性炎症，出现呕吐、痉挛、疼痛及腹泻等。此外，过度吃辣还会对消化道产生强烈的刺激，严重的会使消化道出血，或者诱发溃疡。